Tal vez sea más práctico publicar como sitio web, que así conservas el menú de navegación y puedes pasar de una página a otra.
La presentación es buena, pero si quieres mostrar sólo el contenido, puedes hacer esto:
Te colocas encima, y con el botón derecho, le das a “Este marco – Mostrar el marco en una pestaña nueva” (es la ruta en Firefox, en otros navegadores será algo parecido). Luego puedes copiar la dirección del contenido, y enlazarlo desde cualquier página.
Pero si usas SCORM en una ventana aparte, te quedarás sin navegación, y tampoco se guardarán los datos de la actividad (se guardan sólo en SCORM, no en sitio web).
Espero que te sirva.