En IMS no se muestra el botón por cómo inserta Moodle el contenido generado con eXeLearning. No depende de eXe, sino de Moodle.
TOC son las siglas de “table of contents”. El índice, vamos. Lo mismo: el que pinta eso es Moodle, y para ocultarlo debes hacerlo modificando el tema que uses o añadiendo CSS personalizados a tu aula (si puedes hacerlo, porque no todos los temas ni configuraciones lo permiten). Tal vez lo mejor es que le pidas a quien administre el aula virtual que lo oculte para todos los usuarios, porque no aporta mucho.
Si no necesitas recoger calificaciones (supongo que es así si has pensado usar IMS), tal vez puedas exportar como sitio web y publicar en Moodle una actividad de tipo Archivo. Este vídeo explica cómo hacerlo: https://www.youtube.com/watch?v=h9TQB9vnM_Q
Espero que te sirva.