Al hilo de una pregunta que surgió en los foros de ayuda se me ocurre si, para evitar modificaciones que pudieran perderse al actualizar, podría hacerse que algunas modificaciones menores acompañaran al elp.
Se trataría de que hubiera una caja, como está ahora la del pie, en la que se pudiera incluir css suplementario y que, si esa caja contiene algo, exe lo exportara como archivo css e incluyera un link rel en la cabecera de los exportados para que todo validara correctamente. Igual podría hacerse con javascript.
Como no soy técnico no sé si lo que digo es una barbaridad, pero me pareció que podía ser una solución para modificaciones menores si no se quiere crear un nuevo estilo o para introducir variaciones en los estilos del sistema.