Hola ifanlo:
A día de hoy, eXeLearning no dispone de importación del formato GIFT (aunque se está estudiando la manera de hacerlo).
Yo te recomendaría que importes las preguntas al banco de preguntas de un curso Moodle y que hagas en eXe los contenidos. Podrás hacer cuestinoarios aleatorios para que a cada estudiante se le asignen preguntas diferentes.
Si necesitas mezclar en la misma secuencia contenidos y preguntas, puedes crear en una página del paquete .elp un idevice de tipo Sitio web externo que apunte al cuestionario Moodle. Si optas por esta opción, tendrá que tener una copia del elp por cada curso Moodle, ya que en cada curso Moodle el código del cuestionario será diferente.
¡Un saludo!